- Глазенап Богдан Александрович, адмирал, генерал-адъютант (1848-1849)
- Скаловский Ростислав Карпович, генерал-майор (1849)
- Крашенинников Сергей Петрович, капитан 2 ранга (1850-1853)
- Лисянский Платон Юрьевич, адмирал, адъютант Вел.князя Константина Николаевича (1853-1855)
- Зеленой Иван Ильич, генерал-майор (1855-1860)
- Мельницкий Всеволод Петрович, капитан 2 ранга (1860-1866)
- Зеленой Никандр Ильич, генерал-майор (1866-1886)
- Купреянов Василий Андреевич, капитан 2 ранга (1886-1888)
- Зотов Рафаил Владимирович, подполковник (1889-1893)
- Мордовин Павел Александрович, полковник (1894-1899)
- Вербицкий Петр Николаевич, генерал-майор (1899-1912)
- Житков Константин Георгиевич, лейтенант (1912-1917)
- Лукашевич Сергей Прокофьевич (1918-1919, 1927-1931)
- Новопашенный Пётр Алексеевич, капитан 1 ранга (1919)
- Егорьев Всеволод Евгеньевич (1919-1930)
- Монастырев Нестор Александрович, капитан 2 ранга (1921-1924, г. Бизерта, Тунис)
- Киреев Григорий Петрович (1931-1932)
- Окунев Григорий Сергеевич (1932-1933)
- Стасевич Павел Григорьевич, капитан 1-го ранга (1933-1937)
- Крупский Михаил Александрович, вице-адмирал-инженер (1937)
- Петровский Владимир Алексеевич, контр-адмирал (1939-1941)
- Алафузов Владимир Антонович, адмирал (1941-1942, 1945-1946)
- Пантелеев Юрий Александрович, адмирал (1942-1944)
- Абанькин Павел Сергеевич, адмирал (1944-1945)
- Найда Сергей Федорович, генерал-майор (1946-1949)
- Елисеев Иван Дмитриевич, вице-адмирал (1949-1951)
- Филипповский Александр Александрович, контр-адмирал (1951-1956)
- Вершинин Дмитрий Александрович, контр-адмирал (1956-1969)
- Щедрин Григорий Иванович, вице-адмирал (1969-1973)
- Дыгало Виктор Ананьевич, контр-адмирал (1973-1977)
- Пушкин Александр Сергеевич, контр-адмирал (1978-1987)
- Агафонов Геннадий Данилович, контр-адмирал (1987-1998)
- Веледеев Александр Геннадьевич, капитан 1 ранга (1998-1999)
- Остапенко Виктор Вячеславович, капитан 1 ранга (1999 – по настоящее время)